柯萨奇病毒A组10型构象表位的生物信息学预测

摘要：

近年来,柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)逐渐成为手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)最重要的病原体之一.相比肠道病毒A组71型(Enterovirus 71,EV-A71),CV-A10尚未有上市的疫苗,其构象表位也缺乏系统性研究.本研究利用实验室发展的人肠道病毒构象表位的生物信息学预测算法,对CV-A10的构象表位进行系统性预测.结果 显示:45个氨基酸残基聚集成三簇构象表位:site 1、site 2和site 3.site 1位于病毒衣壳表面峡谷的北侧,site 2和site 3位于峡谷南侧,三者呈现“品”字形分布.site 2和site 3与已报道的两个表位2G8和VP2-P28高度重叠,说明预测结果具有较高准确性.鼻病毒B种14型(RhinovirusB14,RV-B14)、脊髓灰质炎病毒1型(Poliovirus type 1,PV1)和CV-A10同属于人肠道病毒.已有研究表明,RV-B14和PV1的抗原表位也呈三簇分布,且每一簇都与CV-A10的预测结果高度重叠.这既说明了预测结果的准确性,同时也提示三簇构象表位的分布模式可能是人肠道病毒构象表位的基本分布规律.CV-A10构象表位的预测结果,为构象表位的实验鉴定、病毒的分子流行病学研究和疫苗研发提供了重要支持.

关键词：柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)、构象表位、生物信息学预测、手足口病(HFMD)

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分类号：R373.2;R511(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：浙江省基础公益研究计划项目;宁波市自然科学基金;宁波大学研究生科研创新基金;宁波大学大学生科研创新计划

在线出版日期：2019-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：762-769