10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003594
2017~2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析
严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起呼吸道感染的常见病原.为分析河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV-3)检出状况及血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因特征,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)方法对河南省漯河市中心医院于2017年10月10日至2018年12月27日送检的627份SARI病例咽拭子进行核酸检测,筛查HPIV-3阳性标本,对HPIV-3阳性标本用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增其HN基因,并对扩增产物进行序列测定,与GenBank数据库中的国内外HPIV-3 HN基因进行对比分析,绘制系统进化树,并分析基因特征.627份咽拭子标本中,HPIV-3阳性有27份,检出率为4.3%.59%的HPIV-3阳性病例分布于春夏季,发病人群中,6岁以下儿童占96.3%.通过RT-PCR方法共获得18株HPIV-3的HN基因,经过序列测定及对比分析可划分为两个基因亚型:C 3a和C3b.C3a亚型有10株,C3b亚型有8株.18株HPIV-3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.1%~ 100.0%和98.8%~100%.与原型株Wash/47885/57相比,本次扩增18株HPIV-3 HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5% ~ 95.0%和97.0%~97.7%.与GenBank中国内外的HPIV-3 HN基因的代表株比较,其核苷酸及氨基酸同源性分别为94.1%~98.5%和96.8%~97.0%.本研究提示HPIV-3是河南省漯河市儿童SARI病例中检出的病原之一,2017年10月至2018年12月期间,至少有C3a、C3b两个基因亚型的HPIV-3毒株在漯河市共流行.
人副流感病毒(HPIVs)、血凝素-神经氨酸酶蛋白(HN)基因、基因特征、同源性分析
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R373.1;R511(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
国家科技重大专项;国家科技重大专项;高等级生物设施重大事故模拟仿真与风险评估关键技术研究项目
2019-11-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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