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10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003574

一株新正黏病毒(龙川病毒)的鉴定及分子特征研究

引用
2013年在中国广东省开展了虫媒病毒分布及其分子特征的研究,在广东省龙川县采集的致倦库蚊中分离到一株病毒,该病毒可以引起C6/36细胞的病理性效应.为了对该病毒进行鉴定,并对其分子特征进行研究,将病毒培养物用氯化铯进行梯度离心,负染电镜观察病毒的形态,提取并单引物等温扩增(SPIA)病毒RNA,利用Ion Torrent平台进行深度测序,获得的序列用CLC Genomic Wokbench 9.0软件进行拼接,本地BLAST进行分类比对.用MEGA软件登录GenBank,下载正黏病毒科代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析.电镜观察结果显示该病毒呈球形,直径大小约100nm;深度测序共获得6个完整开放阅读框(Open reading fragment,ORF)的节段序列,5个节段(PB1、PB2、PA、NA、HA)的氨基酸序列与正黏病毒科的Quaranjavirus属病毒同源关系在26.38%~67.23%之间,其中PB1的同源性最高,PB2的同源性最低,未发现与其它病毒有同源关系.本研究在中国首次从蚊虫中分离并鉴定了一株新的虫媒病毒,属于正黏病毒科Quaranjavirus属的家族成员,命名为龙川病毒,这是中国国内首次报道从致倦库蚊中分离到龙川病毒.

龙川病毒、致倦库蚊、正黏病毒、分子特征

35

R373.9;R511(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))

广东省医学科学技术研究项目;广东省医学科学技术研究项目

2019-09-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

599-605

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1000-8721

11-1865/R

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2019,35(4)

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