10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003553
北京婴幼儿腹泻中G1、G3型轮状病毒VP7基因分子进化动态分析
北京儿童腹泻中G1和G3型轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行随时间动态变化.鉴于G1和G3型RV在疫苗研发设计中的重要地位,本研究依据前期对2007～ 2017北京腹泻就诊患儿中RV流行的监测结果,分别选取G1(15例)和G3(18例)型RV标本,应用DNAStar、MEGA 6.0和BEAST软件包及Datamonkey在线工具,分析和预测11年来其主要中和抗原VP7基因的分子进化动态.结果 显示G1和G3型RV同近年世界各地的各自主要流行株之间的进化距离近,相比同一进化树分支内参考株的VP7基因并没有表现出特有的氨基酸变异,提示并未有特别的基因变异直接改变北京G1和G3型RV的流行.本研究中北京G1和G3型RV最近共同祖先株形成时间分别约为2005年和1996年,其VP7基因平均进化速率分别为2.29×10-3和5.11×10-4氨基酸替换·位点-1·年-1.尽管G1型的变异速率大于G3型,但有意思的是它们均无正向选择变异位点.群体流行历史(Bayesian skyline plot,BSP)分析显示人群中G1和G3型RV的感染水平呈现缓慢下降,并均在2010年前后出现了跳跃式下降,随后有所上升并维持在较平稳的感染水平,基本符合北京腹泻儿童中RV流行趋势监测,据此推测群体免疫压力可能是影响G1和G3型RV的流行分布随时间动态变化的原因.分子分析结果还显示本研究中G1和G3型RV和相应型别疫苗株之间的进化距离远,且均在主要抗原区存在变异,这些是否对疫苗应用效果产生影响仍需要对RV的流行进行持续监测.
腹泻、轮状病毒(RV)、G1、G3、VP7、分子进化动态
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R373.9;R511(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
北京市科委项目Z11110705056811041;题目:北京儿童急性传染病监测体系的建立;北京市卫计委财政项目2060399PXM2017_026268_00005_00254486;题目:儿童感染性疾病的新发病毒致病机理研究及速检技术平台建立
2019-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
377-384
