安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究
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10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003527

安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究

引用
诺如病毒(Noroviruses,NoVs)是引起病毒性胃肠炎的重要病原体,本研究旨在对2015~2016年春季安徽部分地区暴发的急性胃肠炎(Acute gastroenteritis,AGE)疫情标本进行病原检测和分子分型,分析病原的基因特征.收集2015年3月至2016年5月9起AGE疫情流行病学信息和采集病例粪便、肛拭子样本.采用Real-time PCR检测NoVs核酸和RT-PCR扩增RdRp与VP1区基因序列,基因测序后应用BLAST比对和NoVs在线分型工具分析结果.7起疫情发生在中、小学校(77.78%,7/9),2起疫情发生在乡镇,发病人数中位数为6人,男女发病比例为1.41∶1,临床表现主要以恶心、呕吐/腹泻、腹痛为主.77份临床病例样本中检出66份NoVs核酸阳性,基因序列测定获得76条序列,39条序列为RdRp区GⅡ.P17基因型,37条序列为VP1区GⅡ.17基因型.基因进化树分析显示:2015~2016年安徽地区39条RdRp区NoVs GⅡ.P17基因型序列Cluster Ⅲ进化簇Ⅲ b分支,与2015年广东、海南、中国台湾地区参考毒株序列有较近的亲缘性关系,核苷酸同源性为99%~100%.37条VP1区NoVs GⅡ.17基因型序列都处在Cluster Ⅲ进化簇上,其中28条序列属于Ⅲ a进化分支,与山东2015年LX09株、2016年广东GZ2016-L492株、江苏zj019株、中国香港CUHK-NS-942株以及日本2015年AichiF101毒株序列有较近的亲缘性关系.新型GⅡ.P17-GⅡ.17基因型NoVs是引起2015年和2016年春季安徽部分地区AGE暴发的主要病原体,需加强病毒性胃肠炎流行病学调查与病原监测及分子分型鉴定工作.

诺如病毒(NoVs)、急性胃肠炎、腹泻、基因型、分子进化

35

R373.2;R511(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))

安徽省卫生计生委科研计划项目;题目:安徽地区人感染的诺如病毒分子进化特征及变异研究

2019-05-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

233-239

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病毒学报

1000-8721

11-1865/R

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2019,35(2)

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