大理地区丙型肝炎病毒NS5基因基础上的分型研究

摘要：

对大理地区2014年流行的丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)的非结构蛋白5(Nonstructural protein 5,NS5)基因序列进行分析研究,以了解云南省大理地区流行的HCV基因型或基因亚型.2014年1～10月在大理州人民医院收集临床诊断丙型肝炎病人血清,共收集到血清48份;对这些标本进行病毒核酸提取和反转录合成cD-NA,采用HCV NS5基因特异引物进行RT-PCR扩增,27份标本扩增阳性,序列分析结果显示:5株与基因3a型HCV位于同一进化簇中,核苷酸同源性在90.8％～98.3％之间;14株与基因3b型位于同一进化簇中,核苷酸同源性在87.5％～98.6％之间;5株与基因1b型HCV位于同一进化簇中,核苷酸同源性在91％～97.7％之间;3株与基因6n型位于同一进化簇中,核苷酸同源性在92.8％～96.5％之间,表明本次分离到的27株HCV病毒中,5株属于3a型,14株属于3b型,5株属于1b型,3株属于6n型等3个基因型4个基因亚型.以上研究提示大理地区至少存在1b、3a、3b和6n基因亚型HCV流行,但以基因3型(3a、3b)为主要流行HCV基因型或基因亚型.

关键词：丙型肝炎病毒(HCV)、基因分型、NS5基因序列分析、大理

所属期刊栏目：34

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金31460669

在线出版日期：2019-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：869-876