新城疫强毒株荧光定量RT-PCR检测技术的建立及应用

摘要：

基于国内流行的新城疫病毒强毒株F蛋白裂解位点分子特征设计特异性引物及Taqman探针,建立了一种可检测新城疫强毒株的一步法实时荧光定量RT-PCR方法.通过体外转录法制备cRNA标准品作为阳性模板制作标准曲线以及临床样品的检测绘制出ROC曲线,对诊断指标进行系统评价.结果显示:该方法的标准曲线为Y=-3.390X+38.23,相关系数R2为0.9999;灵敏度试验显示,该方法的最低检测限为2拷贝/μL,比常规RT-PCR高10倍;特异性试验显示该方法与常见禽病病毒无交叉反应;重复性试验的组内和组间的变异系数分别低于1％和1.5％.通过检测1 974份临床样品绘制ROC曲线显示,ROC曲线下面积为0.9861,当Youden Index为93.12时,cutoff值设为35,诊断的敏感性和特异性分别为94.82％、98.3％,与病毒分离方法的Kappa系数为0.919.本研究建立的方法敏感性高、特异性强、重复性好、诊断准确性极好,给实验室提供一种快速、实用的检测临床样品的方法.

关键词：新城疫病毒(NDV)、强毒、荧光定量RT-PCR、ROC曲线

所属期刊栏目：34

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划;公益性行业农业科研专项

在线出版日期：2018-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：541-549