湖州市GⅡ.P16-GⅡ.2型诺如病毒胃肠炎疫情的病原分子特征分析

摘要：

鉴定湖州市2017年11月3起急性胃肠炎疫情的病原,并对病原进行基因特征研究.收集3起疫情中采集的患者粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法对其进行诺如病毒核酸检测,并对核酸阳性标本进行多聚酶和衣壳蛋白部分区域的RT-PCR扩增.选取阳性扩增产物进行序列测定和分子特征分析.同时收集疫情的相关流行病学资料.3起暴发疫情中15份标本经荧光PCR检测为GⅡ型诺如病毒核酸阳性,其中9份标本成功测序.在线分型、系统进化和重组分析判定3起均是GⅡ.P16-GⅡ.2型重组株引起的诺如病毒感染聚集性疫情.系统进化分析显示,本研究中检出的GⅡ.P16-GⅡ.2与2016年底中国各地以及德国、法国检出的GⅡ.P16-GⅡ.2相聚在一起并区别于2016年以前的GⅡ.P16-GⅡ.2形成了一个相对独立的进化分支.提示2016年新出现的GⅡ.P16-GⅡ.2在多聚酶区和衣壳蛋白区都各自经历了一定进化获得了在人群中广泛流行的能力,具体机制有待进一步的研究.这也是首次在本地的诺如病毒胃肠炎疫情中检出GⅡ.P16-GⅡ.2重组株.

关键词：诺如病毒(NoV)、胃肠炎、暴发、基因分型

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分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：浙江省医药卫生科技计划2018RC015;题目:急性腹泻患者中诺如病毒流行优势株的轮换和时空进化动力学研究;湖州市自然科学基金2017YZ04;题目:新型重组诺如病毒GⅡ.17分子流行病学及进化研究

在线出版日期：2018-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：159-164