鸭肠炎病毒感染鸭脾脏的转录组分析

摘要：

为探明鸭肠炎病毒(Duck enteritis virus,DEV)感染鸭脾脏的转录组情况,本研究以DEV GZ株经腿部肌肉接种50 d鸭,于接种后66h采集鸭脾组织样本,提取总RNA,采用Illumina HiSeq 2000TM对试验组和对照组样品进行测序,筛选DEV感染鸭脾脏组织的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG信号通路分析.结果显示,差异表达基因共511个,其中表达上调312个,表达下调199个.GO功能分类结果显示,差异表达基因主要涉及氧运输、整合素活化、补体激活等生物学过程,胞外区、血红蛋白复合物、细胞外间隙等细胞组分,氧转运活动、氧结合、核糖体的结构成分等分子功能.KEGG分析表明这些差异表达基因参与ECM受体相互作用、核糖体、CAMs、JAK-STAT信号通路、细胞因子和细胞因子受体相互作用、PPAR信号通路、神经活性配体/受体相互作用信号通路.本研究为深入探究DEV与鸭脾脏组织互作、宿主抗病机制及相关功能基因的筛选奠定了基础.

关键词：鸭肠炎病毒(DEV)、鸭脾脏、转录组测序

所属期刊栏目：33

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

在线出版日期：2017-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：425-434