EV71-B5亚型在亚太地区流行病学及进化分析
EV71-B5亚型自2003年首次报道以来,在亚太地区频繁引发手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)疫情,并可引起部分婴幼儿重症表现甚至死亡.为了阐明EV71-B5亚型在亚太地区的流行病学规律及进化特征,本文采用分子生物学软件(主要包括BioEdit、MEGA 5.0、Jmodeltest2.1.7、BEAST1.8.2、Tracer1.5、FigTree1.4.3、SPREAD1.0.7),对60条亚太地区的EV71-B5亚型序列进行进化分析及系统发育地理学分析.分析结果显示EV71-B5亚型可在同一地区(中国台湾、泰国等)频繁流行,最近共同祖先的起源时间为2000年9月(95%CI:1999年8月~2001年9月),平均进化速度为4.045×10-3(95%CI:3.222×10-3~4.909×10-s);此外,迁移图谱表明EV71-B5亚型在亚太地区具有明显的迁移传播现象,中国厦门EV71-B5亚型分离株(JN964686)推测来源于新加坡地区(BF=3.17).这种现象提示我国需要加强对该亚型的监测力度,以免发生大范围暴发.
手足口病(HFMD)、肠道病毒71型B5亚型(EV71-B5亚型)、流行病学、进化
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R373.2(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
The present work was supported by the Fund of Pathogen Spectrum Monitoring of Hand,Foot and Mouth Disease in Xiamen and Trends of Genetic Evolution 2013J06016.福建省自然科学基金2013J06016;题目:厦门地区手足口病病原谱监测及基因进化趋势研究
2017-07-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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