高致病性A(H5N6)亚型禽流感病毒全基因组序列测定方法的建立

摘要：

建立以Sanger测序方法为基础的新型A(H5N6)亚型禽流感病毒全基因组扩增方法.从GenBank和Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID)下载近五年H5亚型流感病毒的HA基因序列,N6亚型流感病毒的NA基因序列,以及H5N1和H9N2亚型流感病毒内部6个基因序列,每个基因序列分别进行比对,在相对保守区域设计用于分段扩增的引物,共32对,选用3株病例分离病毒及6株环境分离病毒对引物进行验证.优化后的32对引物能够有效地扩增9株H5N6亚型禽流感病毒,其中3株病例分离病毒的扩增产物条带单一,无非特异扩增.6株环境标本分离病毒扩增产物中,个别反应有非特异扩增产物.建立了一种能够获得高致病性H5N6亚型禽流感病毒全基因组序列的Sanger测序方法,该方法简单、快速,为新型H5N6亚型禽流感病毒的进化分析提供了基础.

关键词：流感病毒、A(H5N6)、全基因组、序列测定

所属期刊栏目：33

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家传染病重大专项项目号:2014ZX10004002,题目:人感染新型流感防控技术研究

在线出版日期：2017-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：19-23