猪流行性腹泻病毒感染PK-15细胞miRNA的差异表达分析

摘要：

为研究猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diahorrea virus,PEDV)对猪肾传代细胞PK-15 miRNA表达谱的影响,将PEDV感染PK-15细胞后,提取总RNA,进行高通量测序,构建感染与未感染PEDV的PK-15细胞的miRNA表达谱,并进行差异性分析,对表达差异显著的miRNA进行heatmap聚类分析及GO (Gene ontology,GO)分子功能(Molecular function,MF)分析,选取10个显著性差异表达的miRNA通过RT-qPCR进行了验证.结果发现,显著性差异表达的miRNA有214个,其中175个miRNA表达上调,39个miRNA表达下调.Heatmap聚类分析表明,病毒组绝大部分差异表达的miRNA较对照组表达量上调,少部分下调.GO分析表明,miRNA广泛参与结合、蛋白结合、蛋白激酶活性、转移酶活性、含磷基团转移、磷酸转移酶活性等生物作用.RT-qPCR验证的各miRNA的表达趋势与高通量测序结果一致.结果表明,猪流行性腹泻病毒感染对PK-15细胞编码的miRNA表达水平有显著影响,从而对进一步研究治疗PEDV的miRNA制剂提供新思路.

关键词：猪流行性腹泻病毒、miRNA表达谱、PK-15细胞

所属期刊栏目：32

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：教育部长江学者奖励计划项目;创新团队发展计划;新世纪优秀人才支持计划

在线出版日期：2016-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：465-471