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犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析

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犬圆环病毒(Dog circovirus,DogCV)是近年来新发现的一种哺乳动物圆环病毒.为研究DogCV中国流行毒株基因组特性和遗传进化,以犬血清样品提取的DNA为模板,采用重叠PCR技术首次获得DogCV中国流行毒株的全基因组序列,命名为JZ98/2014.序列分析表明JZ98/2014全基因组长度为2063nt,编码3个主要开放阅读框:ORF V1(Rep蛋白,303个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,270个氨基酸)和ORF C2(106个氨基酸).同源性比较显示JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株的全基因组序列同源性为82.1 %-89.5%,而Rep和Cap基因同源性分别为82.1%-89.5%和84.6%-89.1%.遗传进化树分析显示,目前世界流行的DogCV存在多个分支,而JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株处于不同分支.

犬圆环病毒、基因、进化分析

32

S852.65+5(动物医学(兽医学))

广西壮族自治区科学基金2012GXNSFAA053073

2016-08-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

429-435

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1000-8721

11-1865/R

32

2016,32(4)

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