犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析

摘要：

犬圆环病毒(Dog circovirus,DogCV)是近年来新发现的一种哺乳动物圆环病毒.为研究DogCV中国流行毒株基因组特性和遗传进化,以犬血清样品提取的DNA为模板,采用重叠PCR技术首次获得DogCV中国流行毒株的全基因组序列,命名为JZ98/2014.序列分析表明JZ98/2014全基因组长度为2063nt,编码3个主要开放阅读框:ORF V1(Rep蛋白,303个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,270个氨基酸)和ORF C2(106个氨基酸).同源性比较显示JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株的全基因组序列同源性为82.1 ％-89.5％,而Rep和Cap基因同源性分别为82.1％-89.5％和84.6％-89.1％.遗传进化树分析显示,目前世界流行的DogCV存在多个分支,而JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株处于不同分支.

关键词：犬圆环病毒、基因、进化分析

所属期刊栏目：32

分类号：S852.65+5(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西壮族自治区科学基金2012GXNSFAA053073

在线出版日期：2016-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：429-435