基于高通量测序技术分析家兔感染猪瘟兔化弱毒株后脾脏的转录组学变化

摘要：

本研究基于高通量测序技术对感染猪瘟兔化弱毒株(C株)后0h,12h,24h,30h,36h,48h的家兔脾脏组织进行测序,以家兔基因组作为参考,筛选感染后各时间点和对照组(0h)之间的差异基因.利用Uniprot和NCBI数据库查找各组中变化水平显著的前10个差异基因的生物学功能.结果发现,感染后12h,24h,30h的前10个差异基因只有少数与炎症、免疫、凋亡等相关;感染后36h,48h的前10个差异基因完全相同,其中B2M、RLA-DR-ALPHA、CD74和IGJ参与抗病毒过程.GO功能注释结果显示:感染后各时间点的差异基因都和免疫、代谢、调控途径紧密相关.KEGG通路富集分析发现,感染后24h的差异基因富集到RIG-Ⅰ样受体信号通路,感染后30h的差异基因富集到黏着斑和细胞外基质-受体相互作用通路,感染后36h和48h的差异基因共同富集到的通路有20个,其中蛋白酶体,溶酶体,核糖体,趋化因子信号通路,B细胞受体信号通路,抗原加工提呈通路和FcγR介导的吞噬通路与抗病毒相关.本研究建立的家兔感染C株后脾脏组织的差异表达基因数据库,将为进一步阐述家兔适应C株的分子机制奠定基础.

关键词：猪瘟兔化弱毒株、家兔脾脏、转录组分析

所属期刊栏目：32

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：内蒙古自治区"草原英才"工程项目10803

在线出版日期：2016-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：316-323