湖南省2009～2014年分离埃可病毒6型的基因特征分析

摘要：

为了解中国埃可病毒6型(Echovirus type 6,ECHO6)的基因特征.通过对2009～2014年从湖南省手足口病病例监测中分离到的6株ECHO6病毒部分VP1序列测定,并与来自中国5个省和世界范围的138株ECHO6病毒进行序列对比和构建系统进化树.中国ECHO6病毒形成2个彼此独立的进化分支,分支1和分支2.湖南省ECHO6病毒均聚集在2c亚分支中,可能具有共同的进化来源.分支2病毒在我国分布较广且流行时间较长,可能是我国的优势流行株.以核苷酸差异＞30％为分组依据,可将ECHO6病毒划分为4个基因组A～D,以核苷酸差异在15％～30％之间分组,将D基因组再划分为10个基因亚组,D1～D10.湖南省ECHO6病毒均属于D7基因亚型.研究结果显示,2009～2014年期间,湖南省存在着具有共同进化来源的ECHO6病毒流行.中国至少存在4个不同进化分支的ECHO6病毒流行.

关键词：埃可病毒6型、基因特征、进化分析

所属期刊栏目：31

分类号：R373.2+4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：世界卫生组织西太平洋区麻疹参比实验室支持项目WPCHNAAA011XZ08;WPCHN1409379

在线出版日期：2015-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：258-263