甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶基因进化分析
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甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶基因进化分析

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通过对甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶(NA)核苷酸进化趋势的研究,进而探寻2013年新型H7N9亚型禽流感病毒产生的根源.本次研究选取美国国立生物技术信息中心(NCBI)的甲型N9亚型流感病毒的NA序列,采用生物软件ClustalX 2.0和MEGA 6.0建立进化树形图.对其欧亚分支,采用BEAST软件2.1.2和Datamonkey interface在线软件,计算和分析选择压力和进化速率.采用Bioedit软件对NA的氨基酸置换熵值计算并分析.系统进化树表明2013年新型H7N9亚型禽流感病毒可划分至现代欧亚分支之内,并且该分支的每位点每年核苷酸置换速率均值为3.8354×101,选择压力dN/dS均值为0.140413.16、19、40、53、81、84、11 2、256、335、359和401的氨基酸变异位点熵值>0.5.研究分析表明2013年新型H7N9亚型禽流感病毒的NA片段基因可能来自甲型N9亚型流感病毒逐步进化的结果,最早可追溯到1996年的A/duck/Siberia/700/1996 (H11N9)流感毒株,新型H7N9亚型禽流感病毒来源不是来自外界环境压力引起突变的结果.

流感病毒、神经氨酸酶、基因进化

31

R373.1;R373.9(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))

2015-05-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

139-144

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病毒学报

1000-8721

11-1865/R

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2015,31(2)

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