静脉注射吸毒感染者体内HIV-1 CRF07_BC的准种变异特征

摘要：

为了研究静脉注射吸毒者(IDU)体内HIV-1 CRF07_BC病毒准种变异和遗传多样性特征,本文采用单基因组扩增(SGA)技术分别从6份CRF07 BC感染者血浆获得HIV-1病毒准种env基因gp120片段序列11～28条,采用构建系统进化树的方法进行聚类分析,描述感染者血浆中CRF07_BC病毒准种的变异特征;运用Simplot软件、分段系统进化树和对平均两两比对基因距离进行遗传多样性作图(Diversity plot)的方法分析病毒准种间的重组.系统进化树分析结果显示仅1个病例具有较高的遗传同质性,而其他5个病例的遗传异质性较高,主要表现为系统进化树上形成2～4个次级进化簇.此外,有3个病例存在病毒准种间的重组.本研究表明SGA技术能有效地分析感染者体内病毒准种复杂的变异特征.

关键词：人类免疫缺陷病毒、单基因组扩增、病毒准种、重组、遗传多样性

所属期刊栏目：29

分类号：R512.91(传染病)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81273136;国家科技重大专项2012ZX10001001-015;北京市预防医学研究中心公益科研课题2012-BJCDC-03

在线出版日期：2013-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：316-322