桂林地区麻鸭DHBV基因全长克隆和序列分析以及DHBV定量检测方法的建立

摘要：

携带鸭乙肝病毒(DHBV)麻鸭作为乙肝动物模型被广泛应用于抗HBV药物活性和毒性研究,广西桂林地区麻鸭具有较高的DHBV携带率,但其DHBV基因组结构特点尚未见报道.本研究克隆了桂林麻鸭DHBV基因组,其序列全长3 027bp,ORF finder分析发现桂林麻鸭DHBV除具有S、P、C开放阅读框架外,还有一编码未知多肽的开放阅读框架,Vector NTI 8.0分析显示该多肽具有与HLA* 0201结合的模体结构.比对不同国家及地区DHBV序列,并以Mega5.0生成进化树提示DHBV序列差异无明显的地域分布特点.以所构建的DHBV S基因重组质粒pGEM-DHBV-S为标准品,建立了荧光定量PCR检测DHBV方法.本研究结果为应用桂林麻鸭作为乙肝动物模型奠定了实验基础.

关键词：鸭乙型肝炎病毒、序列分析、荧光定量PCR

所属期刊栏目：29

分类号：R373.2+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广西自然科学基金项目2012GXNSFAA053146;广西中医药科技专项课题GZKZ-Z1107;桂林科技攻关项目10124008-15及桂林医学院项目驱动研究项目JG2010056资助

在线出版日期：2013-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：180-184