2010年云南省1株ECHO-9病毒全基因序列的遗传特性分析

摘要：

为了解云南省手足口病患者标本中分离到的一株ECHO-9病毒基因组特征,对2010年云南省ECHO-9病毒分离株MSH-KM812-2010全基因组序列测序,并与GenBank中其它ECHO-9病毒株基因组序列比对和分析.MSH-KM812-2010基因组长为7424bp,编码2203个氨基酸,其结构基因区与其它ECHO-9病毒核苷酸和氨基酸的同源性高于其它型别肠道病毒；而在非结构区,与其它肠道病毒血清型的同源性高于ECHO-9病毒株.VP1系统进化分析显示ECHO-9病毒株可形成A、B和C三个进化分支,MSH-KM812-2010株以及其它中国分离株属于C簇.三个分支之间核苷酸序列的差异大于15.0％可将ECHO-9病毒分为三个基因型.通过重组检测软件3(RDP3)和基本局部比对搜索工具(BLAST)比对分析,发现在非结构区可能存在重组.本文首次对我国分离的ECHO-9病毒全基因组序列的测定和分析,对了解ECHO-9病毒遗传特性具有重要意义.

关键词：ECHO-9病毒、全基因组、遗传特性

所属期刊栏目：29

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2013-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：132-136