我国不同基因型水痘-带状疱疹病毒流行毒株gE基因序列分析

摘要：

为进一步了解我国不同地区流行的水痘—带状疱疹病毒(VZV)病毒株的基因型分布和分析代表性病毒株gE基因序列.于2010年12月至2011年6月期间,收集来自北京市、长春市、拉萨市和乌鲁木齐市4个地区水痘和带状疱疹患者的疱疹液拭子和皮肤痂片,共计18份.用单个核苷酸多态性(SNP)谱的方法确定病毒株的基因型.然后采用聚合酶链反应(PCR)方法扩增gE基因的全长片段,并进行测序分析.SNP分析显示18个病毒株的基因型共为4种,其中有7株属于clade2遗传支,1株属于clade3遗传支,4株为clade5遗传支.另有6株病毒兼有不同遗传支的特征,按照目前国际通用的分型方法不能归属于任何明确的遗传支.对不同病毒株gE基因序列分析,除了发现3个国外已有报道的1个同义突变(T660C)和2个反义突变(C119T、C1606A),还发现了3个新的反义突变(C56T、C1109T和C917A)和4个同义突变(C54T、T1075C、T816C和G279A).首次在我国新疆自治区发现了clade5遗传支的VZV,在长春市还发现了目前尚未能分型的6株病毒.对部分病毒株gE基因序列分析,在gE的e1和c1抗原表位的编码区内中检出1个新型反义突变(C917A),需要进一步研究该突变对该病毒免疫原性和致病性的影响.

关键词：水痘-带状疱疹病毒、基因型、gE糖蛋白、单个核苷酸多态性、同义突变、反义突变

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分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金30872253;安徽省科技厅科技攻关项目8010302179

在线出版日期：2013-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：112-118