辽宁省2008~2011年流行性腮腺炎野病毒SH蛋白基因特征分析
本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2008~2011年流行性腮腺炎暴发和散发患者的临床标本中分离到13株流行性腮腺炎野病毒(Mumps virus,MuV),应用逆转录聚合酶链反应(RT- PCR)针对MuV分离株的SH基因的316个核苷酸片段进行扩增,并对该产物进行序列测定.将这13株MuV与从GenBank下载的世界卫生组织(WHO)MuV基因型参考株一起进行分子流行病学研究.结果提示:除2011-015株外,辽宁省2008~2011年12株MuV分离株均属于F基因型,核苷酸和氨基酸同源性为94.9%~100%和83.3%~100%.与F基因型参考株序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.4%~97.2%和96.5%~84.2%.表明2008~2011年辽宁省流行的F基因型MuV发生较大的型内变异.另外还发现F基因型MuV在SH基因上存在着特异性突变(CNt65,C Nt105,G Nt137,C Nt192,C Nt239,GNT262),而其它基因型MuV在这些位点上均未发生改变.F基因型MuV在SH基因编码的氨基酸保守位点也发生变化.如:第2位上由S→P,第6位上由P→L,第23位上由T→N,第48位上由L→P/R.与基因分型有关的氨基酸三联体,2008-01-007毒株也发生了改变,由IML变为TMP.2011-015株病毒与F基因型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为87.5%和79.8%,与G型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为96.8%和97.4%,属于G基因型.该基因型为中国内地首次发现.
流行性腮腺炎野病毒、SH蛋白、基因特征、基因型
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R373.16(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
辽宁省博士科研基金20052135
2012-12-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
506-510