四株不同宿主来源的Class I基因3型新城疫病毒全基因组序列测定及比较分析

摘要：

为了解析基因型相同但宿主来源不同的新城疫病毒的全基因组差异.本文采用RT-PCR方法分别获得4株(JS/3/09/Ch,ZJ/3/10/Ch,AH/2/10/Du,JS/9/08/Go)Class I基因3型病毒的全基因组核苷酸序列,并与GenBank中已公布的Class I基因3型病毒全基因组序列进行比对分析.本实验4株病毒的基因组长度均为15 198bp,在基因组1 607～1 608位有6碱基的缺失,在2 381～2 382位有12碱基的插入,裂解位点为11 2EQ/RQE/GRL117是标准弱毒特征.5株ClassI基因3型病毒之间全基因组同源性超过93％；而与Class Ⅱ弱毒株同源性最低只有72.2％;比较6个结构蛋白基因的同源性,NP基因的同源性最高(98.3％～96.4％),而P基因最低(96.1％～91.9％).结果表明不同宿主来源的Class I基因3型新城疫病毒在遗传信息方面差异不大,但NP/F/L基因的变异幅度较P/M/HN基因明显.

关键词：新城疫病毒、Class I、全基因组序列、不同宿主来源

所属期刊栏目：28

分类号：S852.65+9.5(动物医学（兽医学）)

资助基金：公益性行业农业科研专项;国家高技术研究发展计划（863计划）

在线出版日期：2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：394-402