中国HIV-1 B’亚型毒株不同基因区与全长基因组系统进化比较

摘要：

本研究旨在探索不同基因区的使用对HIV-1B'亚型毒株系统进化分析结果的影响.首先利用既往研究中已发表的共计47条来自泰国,缅甸和中国多个地区不同传播途径的B’毒株近全长基因组序列,将其按基因区分为不同的数据集(gag,pol,vif,vpr,vpu,eni,nef),并分别进行系统进化分析研究.比较不同基因区系统进化分析的结果发现.B’亚型毒株pol基因在分析的基因区中,具有最低的复杂度和进化速率,可以较好的区分B'TH和B’YN毒株,重复近全长基因组序列的分析结果；尽管env基因则具有最高的复杂度和进化速率,但无法获得类似结果.本研究比较了不同基因区对HIV-1 B’亚型毒株系统进化分析结果的影响,对进一步开展HIV分子流行病学调查,分析我国B'毒株在我国的传播奠定了基础.

关键词：HIV-1 B’亚型、pol基因、近全长基因组

所属期刊栏目：28

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家科技重大专项;国家高技术研究发展计划（863计划）;国家国际科技合作专项基金

在线出版日期：2012-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：366-371