家禽市场污水来源的H5N1亚型禽流感病毒NS基因分析

摘要：

对长沙市家禽市场污水来源的H5N1亚型禽流感病毒(Avian influenza viruses,AIV)的非结构蛋白(Nonstructural,NS)基因进行进化和分子特征分析,探讨污水中H5N1病毒的传播风险.9份家禽市场环境污水H5N1亚型AIV标本进行NS基因TA克隆测序,测序结果利用Lasergene和Mega5软件进行氨基酸(amine acid,aa)比对和进化树分析.共得到8个阳性克隆,进化树构建显示8个H5N1的NS基因均属于A亚群,其编码的NS1和NS2蛋白与A亚群代表株(A/chicken/ Hubei/w h/ 1999)aa同源性分别为90.1％～92.5％和91.0％～92.6％,8个H5N1的NS1和NS2 aa之间的同源性分别为93.8％～100.0％和98.4％～100.0％.8个H5N1的NS1蛋白均具有缺失80～84位aa、C末端携带有ESEV的PL基序和第92位aa为E的高致病性分子特征.家禽市场污水来源的H5N1亚型AIV的NS基因具有高致病性的分子特征,这种基因特征表明污水可能传播H5N1病毒.

关键词：禽流感病毒、H5N1亚型、NS基因、进化分析

所属期刊栏目：28

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2012-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：265-271