我国2009年新分离乙脑病毒全基因组序列特征研究

摘要：

本研究对我国2009年新分离的两株乙脑病毒进行全基因组序列测定和分析,以了解病毒全基因组分子特征.通过RT-PCR和核苷酸序列测定方法获得病毒全基因组序列,采用ClustalX、DNASTAR、MEGA等生物学软件完成核苷酸序列及氨基酸序列分析和系统进化分析等.研究结果显示,新分离两株乙脑病毒YN0911和YN0967株基因组全长均为10 965个核苷酸,编码3 432个氨基酸.这2株乙脑病毒之间核苷酸同源性为98.7％,氨基酸同源性为99.8％0.与国际乙脑病毒流行株相比,核苷酸同源性为83.5％～98.9％,氨基酸同源性为94.8％～99.7％.与乙脑病毒疫苗株SA14-14-2相比,在E蛋白有13个氨基酸差异位点,但都位于抗原关键位点之外.这2株病毒在3′UTR区域存在11nt缺失.基于C/PrM区段、E基因、全基因组系统进化分析结果均显示新分离2株乙脑病毒为GI乙脑病毒,并且和越南、四川、贵州、广西以往的分离株遗传进化关系较近.本研究提示我国新分离的2株乙脑病毒均为GI乙脑病毒,决定病毒毒力的关键氨基酸位点未见明显变化.

关键词：乙型脑炎病毒、全基因组、系统进化分析

所属期刊栏目：27

分类号：R512.32(传染病)

资助基金：科技部重大传染病专项;中美新发和再发传染病合作项目

在线出版日期：2012-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：571-579