近年北京人偏肺病毒基质蛋白、小疏水蛋白和粘附糖蛋白的遗传变异特征分析
为了探讨北京地区儿童中流行的人偏肺病毒( Human metapneumovirus,hMPV)结构蛋白基因特征,本研究着重对hMPV北京地区地方株的基质蛋白(Matrix protein,M)、小疏水蛋白(Small hydrophobie protein,SH)和粘附蛋白(Attachment protein,G)基因进行了基因特征的分析.本研究对2006年至2010年42株hMPV的M蛋白、49株SH蛋白和55株G蛋白基因特征进行了分析,进化分析显示北京地区流行的hMPV的这3个编码蛋白基因分别属于A2、B1和B2基因亚型.地方株M基因高度保守,A和B基因型之间存在7个氨基酸位点的变异(型内高度保守).不同基因型(A和B)和不同基因亚型(A2和B1、A2和B2)之间的SH基因的氨基酸同源性在60.7％～64.4％之间,而同一基因亚型内的氨基酸同源性则在93.3％～100％之间；同一基因型不同基因亚型之间(B1和B2)的氨基酸同源性在84.7％～88.7％之间.不同年份不同基因亚型G蛋白具有遗传多样性,使用不同的终止密码、核苷酸缺失和插入导致其核苷酸长度不同,变异程度相当高.不同基因型和不同基因亚型之间的G基因的氨基酸同源性在34.0％～38.6％之间,同一基因亚型内的氨基酸同源性在81.5％～100％之间；同一基因型不同基因亚型之间的氨基酸同源性在64.3％～69.2％之间.2008年至2010年的B2基因亚型的毒株大多数在多个位点出现了相同的氨基酸突变,同时出现了2个氨基酸的插入或重复插入,这些毒株在B2基因亚型内形成了一个新的进化簇.抗原位点预测分析显示不同基因亚型的SH和G蛋白的抗原位点均存在差异.
人偏肺病毒、溃传变异分析、婴幼儿
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R373.1;R725.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家自然科学基金;北京市新星计划;北京市优秀人才培养资助项目
2012-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
557-564
