中国流行的狂犬病病毒时空进化分析

摘要：

本研究对1931～2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化.结果显示:从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共计8个组,分支I包括1～4组,分支Ⅱ包括5～8组;选择压力分析表明中国狂犬病病毒处于较强的净化选择约束下,狂犬病病毒N基因中的核苷酸突变主要是同义突变;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法估计中国狂犬病病毒N基因核苷酸的平均碱基替代率为4×10-4替代/位点/年,共同祖先出现的时间不超过2000年前;迁移分析表明中国狂犬病病毒株存在跨地域传播.

关键词：狂犬病病毒、分子流行病、N基因、地理、中国、生物信息学

所属期刊栏目：27

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家高技术研究发展计划（863计划）2007AA022402

在线出版日期：2011-07-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：231-237