猪源脑心肌炎病毒GXLC株全基因组序列测定与分析

摘要：

对猪源脑心肌炎病毒(EMCV)GXLC株进行全基因组克隆、测序和分析.采用RT-PCR技术分段扩增基因组可读框(ORF),应用3'-RACE和5'-RACE技术扩增3'-UTR和5'-UTR,分别对扩增片段进行克隆和测序.经拼接后获得GXLC株全基因组序列,共7725个核苷酸.与NCBI GenBank登录的国内外参考毒株进行同源性比较及系统进化分析结果表明,GXLC株与GXIO601、GXO602、BJC3、HB1等国内分离株以及CBNU、K3、K11、BEL2887A、EMCV-R、PV21等国外分离株同源性达99%以上;基于全基因组、结构蛋白及非结构蛋白基因序列绘制的系统进化树拓扑结构图相近,所有EMCV分离株可分成两个群:Ⅰ群和Ⅱ群,Ⅰ群可细分为Ⅰa亚群和Ⅰb亚群,其中猪源EMCV属于Ⅰa或Ⅰb亚群、鼠源EMCV属于Ⅰa亚群、野猪源EMCV属于Ⅱ群,GXLC株与其它中国分离株均属于Ⅰa亚群.

关键词：猪、脑心肌炎病毒、基因组、同源性比较、系统进化分析

所属期刊栏目：26

分类号：S852.65~+9.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：公益性行业科研专项;广西自然科学基金;广西壮族自治区科技创新能力与条件建设项目

在线出版日期：2010-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：134-142