检测猪粪便中基因4型戊型肝炎病毒的实时荧光定量RT-PCR方法的建立

摘要：

针对基因4型戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)基因组ORF3设计特异性引物和探针,建立了一套TaqMan实时荧光定量RT-PCR方法.评价了该方法的准确性和灵敏性,同时与常规RT-PCR和巢式RT-PCR方法进行了对比分析.结果表明,生成的标准曲线显示各浓度范围内具有良好的线性关系,相关系数(r2)为0.994,斜率为-3.312,PCR效率为100%.组内和组间重复性试验相同稀释度标准质粒Ct值之间差异均不显著,并且能够准确的从HEV阳性猪粪便样品中检测到基因4型HEV RNA,具有较好准确性.可检测到戊型肝炎病毒数量为(1.7×10~1)copies,比普通RT-PCR的灵敏度高100倍,比Nested RT-PCR高10倍.

关键词：戊型肝炎病毒、RT-PCR、基因4型

所属期刊栏目：26

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金30771609

在线出版日期：2010-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：33-39