鸽圆环病毒浙江株全基因组的克隆及序列分析
鸽圆环病毒(Pigeon circovrius,PiCV)是圆环病毒科的一个成员,是一种免疫抑制性病原,鸽子感染圆环病毒后可以出现昏睡、嗜眠、厌食、体重减轻、呼吸窘迫等症状.本研究应用建立的.PCR方法,检测了从浙江省5个鸽场采集的样品,结果在杭州某鸽场检测到阳性.进一步设计引物分段PCR扩增、克隆并测定了2株鸽圆环病毒的全基因组序列,分别命名为PiCV-zj1和PiCV-zj2,序列的GenBank登录号为DQ090945和DQ090944.基因组序列分析表明,PiCV-zj1及PiCV-zj2全长均为2039bp,具有圆环病毒共同的与病毒复制相关的茎环结构和Rep蛋白保守基序等特征,与已发表的国外11株鸽圆环病毒序列在全基因组核苷酸水平有86%～89.1%的同源性,在Rep和外壳蛋白的氨基酸水平分别有92.1%～94.7%和76.6%～81.4%的同源性.应用PHYLIP方法作进化树分析并应用bootstrap重复1000次进行检验,结果显示:10个欧美株组成一个大的分支,而浙江株和澳洲株各自独立分支.这是我国首次检测确认鸽圆环病毒的存在,并测定了2株PiCV病毒的全基因组序列.
鸽、圆环病毒、全基因组序列
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S852.65+9.2(动物医学（兽医学）)
国家自然科学基金项目30771608;浙江省重点科技项目2007C22051,011102120;宁波市重大科技项目2002D40015
2009-12-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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355-361
