河南省有偿供血者HIV-1外膜蛋白env基因序列分析及表型预测

摘要：

应用套式聚合酶链反应(nested-PCR)从60例河南省HIV-1抗体阳性有偿献血者的外周血单核细胞的DNA样品中扩增全长env基因并对扩增产物测序,共扩增到21个全长env基因,序列分析发现其中15个env基因有完整的可读框(ORF),14个为B亚型,与国际参考株RL42的基因离散率为4.87%±0.31%,1个为B亚型,与国际参考株HXB2的基因离散率为5.43%.根据核苷酸序列推导出相应的氨基酸序列,并且分析及比较了重要的功能结构域.发现这15个序列的N糖基化位点和数目没有显著变化;CD4受体结合位点高度保守;根据V3环氨基酸序列及净电荷数目,预测大多数分离株使用CCR5辅助受体;V3环四肽序列以典型欧美B亚型GPGR最多,占40%;gp120/gp41剪切位点高度保守,预测所有gp160前体都能有效剪切;四种广谱中和抗体2G12、IgG1b12、4E10及2F5的识别位点高度保守,表明大多数分离株对这四种中和抗体敏感.有必要进一步阐明env基因型与相关功能的关系,这将为疫苗研究和药物开发提供依据.

关键词：供血者、HIV-1、序列测定、基因、env

所属期刊栏目：25

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）;国家自然科学基金

在线出版日期：2009-06-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：88-94