中国分离巴泰病毒基因组全编码区序列测定和分析

摘要：

采用RT-PCR和TAIL-PCR方法,首次对我国分离的巴泰病毒(YN92-4株)基因组的全编码区进行序列测定和分析.结果显示,YN92-4株病毒基因组由S、M、L三个片段组成,长度分别为947、4 371、6 860个核苷酸.其中,S片段基因编码由234个氨基酸残基组成的核衣壳蛋白和由102个氨基酸残基组成的非结构蛋白,M片段基因编码由1 435个氨基酸残基组成的前体蛋白,L片段基因编码由2 239个氨基酸残基组成的RNA聚合酶.与国外其它地区的巴泰病毒分离株进行基因组全编码区序列比较后发现,YN92-4株与日本牛血清分离株(ON-7/B/01株)在S、M片段核苷酸(氨基酸)的同源性最高,分别为97.7%(100%)和95.7%(98%);由于本研究首次开展对巴泰病毒L基因片段核苷酸序列的研究,因此国际基因库尚无可参考的序列信息,本研究比较了我国分离的巴泰病毒与同一血清组的代表病毒Bunyamwera病毒L片段的核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为73.5%和81.6%.系统进化分析显示,YN92-4株基因组与其它巴泰病毒分离株在各自分支下形成独立分支.本研究提示我国分离的巴泰病毒YN92-4株未发生基因重配(如Ngari病毒),其基因组与日本牛血清分离株(ON-7/B/01株)的亲缘关系密切.

关键词：巴泰病毒、序列测定和分析、TAIL-PCR

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分类号：R373;Q78(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金;中美新发和再发传染病项目;中法先进研究计划

在线出版日期：2009-06-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：83-87