戊型肝炎病毒通用性PCR引物的设计及其基因分型的研究

摘要：

针对戊型肝炎病毒(IEV)基因分型尚无统一标准的现状,本研究通过分析GenBank中现有的82株HEV基因组全序列,设计一组HEV通用性PCR引物(HEVuPrimer)用于扩增不同基因型HEV可测序长片段,分别基于全基因序列、HEVuPrimer扩增序列和较常用的MXJ引物扩增序列对82株HEV进行基因分型,再以HEVuPrim-er扩增1～4型HEV参考株和HEV IgM抗体阳性的临床标本,进行HEV基因分型的研究.研究结果表明HE-VuPrimer扩增区段与全基因序列对82株HEV的基因分型结果完全一致;HEVuPrimer与HEV序列的匹配程度明显高于MXJ引物,且HEVuPrimer区段的基因分型结果较MXJ区段的更为准确.HEVuPrimer可同时扩增出不同基因型HEV基因片段.124份临床标本中,60份测出特异性HEV RNA,阳性率为48.4%,基因分型结果均为4型HEV,但分属于4个不同的基因亚型,核苷酸同源性为80.O%～99.9%,其中有6例近期分离的HEV毒株形成一新的基因亚型.因此,基于HEVuPrimer扩增区段的HEV基因分型方法具有较高的可靠性和可信度,为建立统一、可行的HEV基因分型标准提供了新的思路.

关键词：戊型肝炎病毒、基因分型、通用性引物、逆转录-套式聚合酶链反应

所属期刊栏目：25

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：江苏省自然科学基金;国家高技术研究发展计划（863计划）;国家自然科学基金;江苏省高技术项目

在线出版日期：2009-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：9-16