H1N1亚型猪流感病毒广东分离株全基因克隆及其遗传演化分析

摘要：

为了研究H1N1亚型SIV遗传演化与变异的特性,采用RT-PCR技术分别扩增A/Swine/Guangdong/LM/2004(H1N1)的8个基因片段,分别将其克隆到pMD18-T载体,进行全基因组序列测定.核苷酸序列测定结果显示:LM株SIV各基因片段均未发现核苷酸插入或缺失现象.HA切割位点处的氨基酸序列序列为IPSIQSR↓G,与高致病性SIV的H1N1亚型毒株的分子特征不符合.HA基因含有6个潜在的N-糖基化位点,4个在HAl的第11、23、87、和276位,增加2个分别在HA2的154和213位点;NA基因不仅在58、63、68、88和146位含有高度保守的N-糖基化位点,而且在44和235位增加2个潜在的N-糖基化位点,这可能是近期H1N1亚型SIV的一个分子特征.核苷酸同源性结果:HA基因与类人谱系的流感病毒分离株有很高的同源性(99%),而其他基因均与古典猪谱系的流感病毒分离株同源性较高(87%～98%).从绘制的各个片段进化树和核苷酸同源性分析结果,可以推测该毒株HA基因可能来源于类人谱系的流感病毒;而其他基因来源于古典猪谱系的流感病毒.

关键词：猪流感病毒、RT-PCR、克隆、遗传演化分析

所属期刊栏目：24

分类号：S852.65+9.5;Q78(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家"十一五"科技支撑计划资助项目2006BAD06A05;黑龙江省自然科学基金项目ZJN-0702-02

在线出版日期：2008-12-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：358-363