广西不同时期IBV分离株S1基因高变区Ⅰ的遗传变异分析

摘要：

对广西1985～2007年间分离到的22株传染性支气管炎病毒(IBV)的S1基因高变区Ⅰ(HVR Ⅰ)进行序列测定,并与发表的其他IBV参考株及鸽子分离的冠状病毒株的基因序列进行比较和分析.系统进化关系显示毒株可分为5个基因群,其中有16个广西分离株属第Ⅰ群,它们与鸽子冠状病毒分离株的氨基酸序列同源性较高,与Massachusetts(Mass)型疫苗株的同源性较低.有15个分离株在33～34位和34～35之间分别有4个和3个氨基酸残基的插入,GX-NN6在33～34位和34～35位之间则均有4个氨基酸残基的插入;GX-YL1、GX-NN2与常用的Mass型疫苗株的亲缘关系最近,同属于第Ⅱ群;GX-G、GX-XD与日本同一时期分离的毒株JP Miyazaki 89亲缘关系最近,属于第Ⅲ群;GX-YL6、GX-NN7与欧洲毒株4/91亲缘关系较近,属于第V群.结果表明广西存在着多种类型IBV毒株的流行,毒株S1基因HVR Ⅰ碱基的突变或插入比较普遍,可导致其氨基酸序列的变化,绝大部分毒株与目前常用的Mass型疫苗株的亲缘关系较低.同一时期的分离株同源性较高,但无明显的地域性差异.

关键词：传染性支气管炎病毒、分离株、S1基因高变区Ⅰ、序列测定、遗传变异、基因型

所属期刊栏目：24

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金30700599;广西自然科学基金桂科青0728003;广西教育厅资助项目C150002;广西大学校科研和教改项目DD150032;硕士研究生科研创新项目2007105930906M87

在线出版日期：2008-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：126-132