SPF鸡胚中内源性白血病病毒全基因序列鉴定与分析

摘要：

摘要:以国内某3家SPF鸡场的SPF鸡胚成纤维细胞提取的基因组DNA为模板,参照已发表的序列,设计合成了4对检测内源性白血病病毒引物,分别检测gag基因、pol基因、env基因和LTR片段,结果显示4者检出阳性率很高(gag,29/46;pol,27/46;env,24/46;LTR,31/46).设计合成了8对引物,选取4片段检测均为阳性的样品之一,经PCR成功扩增出了8段连续的、相互部分重叠的目的DNA片段,分别连接入T载体进行克隆测序.用DNAstar软件对测序结果进行拼接,从一个鸡胚得到了内源性白血病病毒前病毒全基因组序列.比较分析发现,该序列env基因与已知的E亚群内源性病毒代表株env基因的核苷酸序列同源性在98.5%以上,全基因组序列同源性在99.1%以上,而与其他亚群代表株同源性相对较低,env基因同源性仅为56.3%～91.5%.

关键词：内源性白血病病毒、全基因组核苷酸序列、同源性分析

所属期刊栏目：24

分类号：S852(动物医学（兽医学）)

资助基金：山东省科技攻关项目2005GG4409001;山东省优秀中青年科学家研究奖励基金2006BS06005

在线出版日期：2008-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：53-58