牙鲆淋巴囊肿病毒中国株(LCDV-C)羟类固醇脱氢酶基因的特征分析

摘要：

属于虹彩病毒科的淋巴囊肿病毒(Lymphocystis disease virus,LCDV)是一类能引起全球各地上百种淡、海水鱼产生囊肿的病原.在新分离到淋巴囊肿病毒中国株(Lymphocystis disease virus isolate from China,LCDV-C)并完成序列测定的基础上,用计算机辅助分析了LCDV-C羟类固醇脱氢酶(hydroxysteroid dehvdrogenase,HSD)基因结构特征,LCDV-C HSD读码框为1 023bp,推导其编码含340个氨基酸、分子量约为39.3kD的蛋白质.对来自10个不同病毒株或物种的HSD蛋白序列进行的比较分析显示,LCDV-C与淋巴囊肿病毒代表株(LCDV-1)的HSD氨基酸同源性最高,为60.5%.对LCDV-C HSD的二级结构进行了预测,有亲水区5个,抗原区、α螺旋区和β折叠区各有6个.经密度排列界面(dense alignment surface,DAS)的方法预测,表明LCDV-C HSD有一个跨膜结构域.

关键词：淋巴囊肿病毒中国株、虹彩病毒、羟类固醇脱氢酶、病毒基因结构分析

所属期刊栏目：21

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2001AA626030,2002AA626010;中国科学院知识创新工程项目KSCX2-SW-302;水生生物研究所领域前沿项目220313

在线出版日期：2005-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：131-135