我国新分离ECHO30病毒VP1序列分析

摘要：

测定了引起2003年苏北地区无菌性脑膜炎暴发流行的病因病毒FDJS03分离株的VP1基因序列,并与国外同型流行毒株做比较,以了解本流行株的分子生物学特点及遗传变异规律.随机选取FDJS03分离毒株中的4株,用肠道病毒VP1序列的特异性引物008/011进行RT-PCR,扩增产物经凝胶纯化后测序.将序列输入GenBank,用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取32株不同地区不同年代的ECHO30分离毒株,在PHYLIP3.573c和TREE-PUZZLE5.0中构建进化树,比较它们完整VP1序列(876nt)的进化关系.核苷酸和氨基酸同源性比较结果证明:4株分离病毒均为ECHO30.进化树分析显示:本次FDJS03分离株与欧美20世纪70、80年代流行株亲缘关系最近,但自成一簇,与国外毒株仍然有地区差别.ECHO30的VP1基因进化有时间效应,但存在地区差异.本次流行的病原可能是单一基因型的ECHO30病毒.

关键词：ECHO30、无菌性脑膜炎、肠道病毒、序列分析、同源性

所属期刊栏目：21

分类号：R373.34(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2005-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：101-105