汉坦病毒汉滩型特殊新亚型的发现

摘要：

应用RT PCR扩增了皖南山区分离株AH09的M和S片段全基因,克隆于T载体,纯化后测定序列.结果AH09株M片段的全基因序列共3 625个核苷酸,编码1 135个氨基酸;S片段的全基因序列共1 724个核苷酸,编码430个氨基酸.M和S片段全基因核苷酸和氨基酸与汉坦病毒各型毒株的代表株和HTN型毒株的同源性比较表明,AH09株分枝与HTN型接近,与其它各型病毒则相距较远,故确定为HTN型毒株.但AH09株与HTN型毒株的M和S片段全基因序列有差异,其差异分别高达23.6%和20.4%.经种系发生分析,AH09株是迄今为止所发现的HTN型病毒中差异最大的新基因亚型病毒株.AH09株病毒M片段的氨基酸与HTN型相差13.5%至14.8%,而S片段仅相差7%～8.1%,说明AH09毒株的变异主要发生在M片段.而ORF和3′端的NCR区核苷酸序列分析比较说明,病毒的变异更主要集中在该片段的3′端的NCR区.

关键词：汉坦病毒、M和S片段、序列测定、亚型、系统发生树

所属期刊栏目：17

分类号：R373.3+2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：215-220