水稻条纹病毒RNA4基因间隔区的分子变异

摘要：

应用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）和单链构象多态性（single-strandconformationpolymorphism，SSCP）技术快速检测我国水稻条纹病毒（RSV）RNA4基因间隔区（intergenicregion，IR）的分子变异,结果表明，我国RSVRNA4IR存在分子变异。供试的7个分离物共有4种泳动带型，其中YL、BS、JD、LY分离物完全一致，而SQ、PJ、JN各不相同。序列测定证实了PCR-SSCP结果。各分离物RNA4IR序列均由654个核苷酸组成，其中YL、BS、YL及JD4个分离物序列完全一致；JN、PJ、SQ3个分离物各不一样，序列之间的同源性均在92％～94％之间。IR序列内部具有两个重要的结构特征：（1）有两处反向重复序列，可形成两个明显的发夹结构，其中一个序列比较保守，形成的发夹结构稳定；但另一个发夹结构由于碱基变异导致其稳定性在各个分离物中差异较大；（2）具有插入序列，相对于日本M分离物，我国7个分离物都有一段长19bp的插入序列，这段插入序列比较保守，各分离物之间仅有1～2个碱基的差异。

关键词：水稻条纹病毒、RNA4基因间隔区、PCR-SSCP、序列分析

所属期刊栏目：17

分类号：S432.4(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金39670489;福建省自然科学基金C97031

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：144-149