水稻条叶枯病毒基因组组分3的克隆与序列分析

摘要：

利用RT-PCR技术,合成并扩增了水稻条叶枯病毒(RStV)中国云南分离物基因组组分3的全长cDNA.将PCR产物克隆在载体pCRⅡ上,进行全序列测定.将所得核苷酸序列及其所推导的氨基酸序列与日本分离物T进行同源性比较,结果表明,在核苷酸水平上,两分离物的5′端非编码区序列相同,vORF、vcORF及基因间非编码区序列的同源性分别为97.6%、96.8%及87.6%,而3′端非编码区同源性为98.9%,仅有一个核苷酸不同;在氨基酸水平上,vORF及vcORF编码蛋白的同源性分别为99.1%和98.5%.可见编码区的大小及其氨基酸序列和两末端序列都是很保守的.序列分析显示,两个RStV分离物的RNA3均有双义编码特性.因此,中国云南分离物Y与日本分离物T可能有很近的亲缘关系.

关键词：水稻条叶枯病毒、水稻条叶枯病、序列分析

所属期刊栏目：16

分类号：S435.11;Q785(病虫害及其防治)

资助基金：美国McKnight Foundation;上海市科委资助项目

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：44-48