传染性法氏囊病病毒中国强毒株A节段cDNA基因的克隆和序列分析

摘要：

以来自哈尔滨传染性法氏囊病病毒(IBDV)强毒株(Harbin毒株,H)的基因组RNA为模板,用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)的方法得到了其A节段的全长cDNA片段,分5＇端(1 659bp)和3'端(1 444bp)上下两段分别克隆到pGEMB®-T载体上,测定了其核苷酸顺序,在长为3 101 bp中含有两个阅读框ORF A1和ORF A2,分别编码1 012个氨基酸的前体蛋白(VP2-4-3)和145个氨基酸的VP5,ORF A1和ORF A2有部分的重叠.将核苷酸序列及推测出的氨基酸序列与已报道的IBDV血清Ⅰ型和Ⅱ型毒株的相应序列进行了比较,结果表明:H毒株与其它血清Ⅰ型毒株之间,在核苷酸水平上存在25bp-267bp的差异;在氨基酸水平上存在17～40个氨基酸的差异.在VP2-4-3内比较显示,H毒株与P2、Cu-1之间氨基酸的差异最小为1.7%,H毒株与UK661之间氨基酸的差异最大为3.9%.变异主要发生在VP2的可变区(206-350位氨基酸),在H毒株所特有的12个氨基酸当中,该区就占5个,代表1.76%的变异.VP4、VP3和VP5区各有两个特有氨基酸的替代,分别代表0.74%、0.69%和1.38%的变异.序列分析显示,H毒株在抗原性和毒力上均存在着变异,然而,它既不同于欧洲、日本和以色列分离的超强毒,也不同于美国的变异株.与其亲缘关系最近的是欧洲的较早期的分离株,但是在可变区,尤其是在两个亲水区又有明显的突变.

关键词：传染性法氏囊病病毒A节段cDNA、反转录聚合酶联反应(RT-PCR)、分子克隆、序列分析

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分类号：S858.31;Q343.1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金39893290;北京市自然科学基金5952004;高等学校博士学科点专项科研项目

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：330-338