安徽省蚌埠市麻疹野毒株核蛋白基因检测及序列分析

摘要：

目的:通过检测麻疹野毒株的基因型,分析安徽省蚌埠市麻疹病毒流行株的基因特征,为麻疹监测和防治提供依据.方法:选取2010～2011年蚌埠市散发的15例临床确诊为麻疹的患者,收集患者急性传染期的尿液标本,提取病毒RNA,用RT-PCR方法扩增麻疹病毒核蛋白基因羧基末端的515 bp核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,构建基因亲缘关系树.结果:15份麻疹患者尿液标本中有14份分离到麻疹野毒株;将其中3株麻疹野毒株的核蛋白(N)羧基末端515 bp核苷酸与Genebank中麻疹病毒的8个参考株进行基因同源性关系比较,与Genebank中公布的H1、H2基因型参考株Hunan.CHN93-7、Beijing.CHN94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.020～0.026和0.064～0.075;而与H1a参考株China 93-2的遗传距离最近,为0.009～0.015;3株麻疹野毒株N羧基末端515个核苷酸的同源性为97.8%～98.9%;与H1参考株Hunan.CHN93-7、H1a参考株China 93-2和H1b参考株China 94-7的核苷酸同源性分别为97.4%～98.0%、98.5%～99.1%和96.5%～97.1%.结论:蚌埠市麻疹野毒株的优势基因型为H1a基因亚型.

关键词：麻疹病毒、野毒株、序列分析、基因型

所属期刊栏目：38

分类号：R373.11(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：蚌埠医学院科研课题资助项目BY1036

在线出版日期：2013-07-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：604-607