基于生物信息学分析喹啉酸磷酸核糖基转移酶在恶性黑色素瘤中的表达及潜在生物学功能

摘要：

目的 通过生物信息学方法分析喹啉酸磷酸核糖基转移酶(QPRT)在恶性黑色素瘤中的表达及潜在生物学功能.方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)检索恶性黑色素瘤患者的临床资料.应用基因表达谱互动分析(GEPIA)数据库对TCGA数据库中恶性黑色素瘤组织和正常皮肤组织中QPRT mRNA表达水平进行分析.应用UALCAN数据库对TCGA数据库中不同临床分期恶性黑色素瘤组织中QPRT mRNA的表达水平进行分析.应用GEPIA数据库分析不同QPRT mRNA表达情况恶性黑色素瘤患者的预后.应用人类蛋白质参考数据库(HPRD)分析正常皮肤组织、原发性黑色素瘤组织及转移性黑色素瘤组织中QPRT蛋白的表达情况.应用GeneMANIA数据库查找与QPRT相互作用的蛋白,将与QPRT相互作用的关键基因利用WebGestalt进行基因本体(GO)分析,了解其参与的细胞组分、生物过程、生物功能.结果 恶性黑色素瘤组织中QPRT mRNA表达水平明显高于正常皮肤组织,差异有统计学意义(P﹤0.01).Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ期恶性黑色素瘤患者的QPRT mRNA表达水平比较,差异无统计学意义(P﹥0.05).QPRT低表达组患者的总生存情况和无病生存情况均优于QPRT高表达组,差异均有统计学意义(P﹤0.05).免疫组化显示,正常皮肤组织中QPRT蛋白阴性表达,恶性黑色素瘤组织中QPRT蛋白呈强阳性表达.GeneMANIA数据库中筛选出20个与QPRT相互作用的蛋白,相关关键基因主要参与蛋白结合、离子结合、核酸结合及转运活性等.结论 QPRT基因在恶性黑色素瘤中高表达,其高表达与恶性黑色素瘤患者的预后不良相关,可能成为筛查恶性黑色素瘤的标志物及治疗靶点.

关键词：恶性黑色素瘤、喹啉酸磷酸核糖基转移酶、公共数据库、生物信息学

所属期刊栏目：21

分类号：R739.5(肿瘤学)

在线出版日期：2023-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1090-1094,1109