基于生物信息学方法分析软组织肉瘤中甲状腺激素受体相互作用蛋白13的表达及临床意义

摘要：

目的 探讨甲状腺激素受体相互作用蛋白13(TRIP13)在软组织肉瘤中的表达及临床意义.方法 应用Oncomine、GEPIA、CCLE和Kaplan-Meier Plotter数据库分析TRIP13在软组织肉瘤中的表达及与预后的关系.应用cBioPortal数据库分析软组织肉瘤中TRIP13突变情况及与患者预后的关系.应用String数据库构建蛋白质相互作用网络,应用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 TRIP13在大部分肿瘤中表达水平升高.在软组织肉瘤组织和细胞中,TRIP13表达水平均升高.TRIP13高表达与软组织肉瘤患者的预后差有关.21％的软组织肉瘤患者发生TRIP13基因突变,与TRIP13未突变组患者相比,TRIP13突变组患者的中位总生存期(OS)和中位无病生存期(DFS)均明显较短.应用String数据库共获得10个与TRIP13相互作用的蛋白,这些蛋白主要具有激酶结合、腺苷三磷酸(ATP)酶活性、蛋白激酶活性等生物学功能,主要参与细胞周期、人T细胞白血病病毒1感染、黄体酮介导的卵母细胞成熟、卵母细胞减数分裂及病毒致癌过程.结论 TRIP13在软组织肉瘤组织和细胞中表达水平均较高,其与软组织肉瘤患者的预后有关,有望成为软组织肉瘤诊断和治疗的生物标志物.

关键词：甲状腺激素受体相互作用蛋白13、软组织肉瘤、生物信息学、数据挖掘、预后

所属期刊栏目：20

分类号：R739.9(肿瘤学)

资助基金：陕西省自然科学基础研究计划项目2018JM7105

在线出版日期：2022-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1015-1019