细胞分裂周期蛋白6拷贝数变异与肺腺癌患者预后关系的研究

摘要：

目的 探讨细胞分裂周期蛋白6(CDC6)基因在肺腺癌组织中的拷贝数变异(CNV)对肺腺癌预后的影响.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取肺腺癌患者的转录谱(mRNA)数据、CNV数据及临床资料,使用基因表达谱动态分析(GEPIA)数据库对CDC6基因在肺腺癌组织中的表达情况,及其与CDC6基因CNV和肺腺癌患者预后的关系进行分析.筛选CDC6基因的共表达基因,并进行基因组百科全书(KEGG)通路分析及基因本体(GO)功能富集分析.结果 肺腺癌患者肿瘤组织中CDC6基因CNV与CDC6 mRNA的表达量呈正相关(P﹤0.01).CDC6低表达组肺腺癌患者的生存结局明显优于CDC6高表达组患者(P﹤0.01).KEGG通路分析结果显示:CDC6基因的共表达基因富集在DNA复制、错配修复、核苷酸切除修复等修复相关通路.GO功能富集分析结果显示:在生物学过程层面,CDC6基因的共表达基因主要参与了DNA链的延伸、核酸切除修复、蛋白质去甲酰化、转录偶联切除修复、WNT信号通路、平面细胞极性通路、核因子-κB诱导激酶(NIK)/核因子-κB(NF-κB)信号通路;在细胞构成层面,CDC6基因的共表达基因参与了T复合物、透明带受体复合物、驱动蛋白复合体、DNA复制因子C复合物的形成;在分子功能层面,CDC6基因的共表达基因参与四链体DNA结合.结论CDC6基因CNV可以对肺腺癌组织中CDC6基因的表达进行调控,CDC6基因及其共表达基因可对肺腺癌的DNA复制、修复过程和肿瘤相关信号通路进行调控并可能以此为基础影响肺腺癌的发展进程.CDC6基因高表达肺腺癌患者的预后不良,其可能成为预测肺腺癌临床预后的有效生物标志物.

关键词：TCGA数据库、肺腺癌、拷贝数变异

所属期刊栏目：17

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：河北省科技计划项目H2017209233

在线出版日期：2019-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2259-2263