食管癌淋巴结转移相关基因的转录水平筛选及网络分析

摘要：

目的 从转录组水平筛选食管癌淋巴结转移相关基因,为深入研究食管癌淋巴结转移提供线索.方法 利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据资源,采用随机森林分类方法从转录水平分析、筛选食管癌淋巴结转移相关基因,并对其进行功能聚类.结果 获得了与食管癌淋巴结转移相关基因的相关显著性排序,分析获得的重要相关基因集的功能主要集中在细胞代谢及DNA修复、转录等的调控上,并在其中获得了与食管癌淋巴结转移密切相关的代谢及DNA调控领域中的重要节点基因.结论 Heatmap图显示获得一簇明显的淋巴结转移相关基因,聚类分析显示这些基因主要集中在代谢和DNA调控等功能上,网络分析获得了KRAS、PPM1B、PPP3CA、ATR、WRN、TOP2B等与食管癌淋巴结转移相关的重要节点基因.

关键词：食管癌、淋巴结转移、转录水平

所属期刊栏目：15

分类号：R735.1(肿瘤学)

在线出版日期：2017-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：243-245