食管癌细胞系KYSE150中RNA干扰MTA1的基因芯片分析

摘要：

目的 探讨MTA1对食管癌转移相关基因的影响.方法 用RNA干扰的方法在食管癌细胞系KYSE150中沉默MTA1基因的表达,随后进行转移相关基因芯片分析.以两次芯片分析中均上调2倍以上(或下调1/2)为差异显著基因.通过DIVID生物信息学数据库进行gene ontology的通路分析.结果 在两次基因芯片分析中均有意义上调的基因共有7个,分别是LAMC1、MMP14、MMP15、MDM2、API5、ODC1、PTGS2;而两次均显著下调的基因共有14个,它们是CSF1R、HGF、IGF2、ITGA6、MMP9、MMP11、MMP13、CASP8、CTSD、TMPRSS4、THBS2、TIMP1、ENPP2、SNCG.通过在DAVID生物信息学数据库中对上述表达差异显著的基因进行通路分析,结果提示差异基因主要富集在5条信号通路上,分别是肿瘤信号通路(MDM2、CASP8、CSF1R、HGF、ITGA6、LAMC1、MMP9、PTGS2)、ECM受体整合信号通路(LAMC1、THBS、ITGA6)、基质金属蛋白酶信号通路(TIMP1、MMP9)、小细胞肺癌信号通路(ITGA6、Cox2)和黏着斑信号通路(ITGA6、HGF、IGF2).结论 MTA1参与了转移相关的一系列分子改变事件,尚需进一步的分子生物学方法验证这些基因调控的信号途径.

关键词：MTA1、肿瘤转移、食管癌、RNA干扰、基因芯片

所属期刊栏目：10

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：国家自然基金81071773、81101518;国家重点基础研究发展计划2009CB521807

在线出版日期：2012-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：211-215