柯萨奇病毒A组10型感染RD细胞的转录组学分析

摘要：

探讨柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus A10,CV-A10)感染人横纹肌肉瘤(rhabdomyosarcoma,RD)细胞的基因表达谱变化,为深入理解CV-A10致病机制提供重要基础数据.本研究将CV-A10以感染复数(MOI)为0.1的剂量感染RD细胞12 h后提取总RNA,通过RNA-Seq技术获取RD细胞中的全部转录本信息,基于生物信息学的方法对差异表达基因进行GO(gene ontology,GO)和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.结果显示,共筛选到 2 610 个差异表达基因,其中表达上调的基因有1 582个,表达下调的基因有1 028个.随机选取8个差异表达基因,经RT-qPCR验证后发现,其变化趋势与转录组数据一致.GO和KEGG富集分析结果显示,差异表达基因主要聚焦于细胞内信号转导、mRNA加工、抗病毒免疫反应等过程.结果表明,CV-A10感染可能会引起RD细胞发生自噬.

关键词：柯萨奇病毒A组10型、人横纹肌肉瘤细胞、转录组学

所属期刊栏目：45

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金81660280

在线出版日期：2023-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：185-192