欧洲红豆杉AP2/ERF转录因子基因序列分析

摘要：

以东北红豆杉AP2转录因子氨基酸序列为查询序列,搜索比对欧洲红豆杉基因组草图数据得到一个AP2转录因子全长序列,并命名为TbAP2.同时,利用生物信息学方法对TbAP2基因序列及其编码蛋白进行了特征分析和功能预测,发现该基因全长1 817 bp,编码一个217个氨基酸的ORF;TbAP2相对分子量为23.68×103,等电点为4.92,亚细胞定位分析推测该转录因子定位在细胞核中,保守结构域分析发现其含有一个典型的AP2结构域,除与东北红豆杉具有99％的高一致性外,还分别与杨树、苜蓿和大豆的AP2蛋白具有81、80％和78％的高一致性,进化树分析表明,相近科属植物的AP2转录因子归为一类,红豆杉AP2转录因子与玉米的AP2转录因子亲缘关系最近.本研究获得了TbAP2基因电子序列,为更好地利用分子生物学技术调控紫杉醇的生物合成提供理论基础.

关键词：红豆杉、AP2、转录因子、生物信息学、紫杉醇

所属期刊栏目：36

分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项CAFYBB2014QB001;国家自然科学基金项目31300567,31170628

在线出版日期：2015-01-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：54-59